Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERG0

Lima1, LIM domain and actin-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lima1Q9ERG0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lima1Q9ERG0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lima1Q9ERG0 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
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