Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Clstn2Q9ER65 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Clstn2Q9ER65 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms