Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Barx1Q9ER42 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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