Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clstn1Q9EPL2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms