Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CrotQ9DC50 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrotQ9DC50 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrotQ9DC50 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrotQ9DC50 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrotQ9DC50 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CrotQ9DC50 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CrotQ9DC50 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrotQ9DC50 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrotQ9DC50 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrotQ9DC50 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrotQ9DC50 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrotQ9DC50 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CrotQ9DC50 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CrotQ9DC50 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms