Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Hmg20aQ9DC33 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms