Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Syde1Q9DBZ9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms