Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf6Q9DBU5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf6Q9DBU5 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms