Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SrpraQ9DBG7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SrpraQ9DBG7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms