Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SelenooQ9DBC0 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SelenooQ9DBC0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms