Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Smg9Q9DB90 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Smg9Q9DB90 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smg9Q9DB90 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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