Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Fundc1Q9DB70 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms