Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Med27Q9DB40 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Med27Q9DB40 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms