Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Prpf4Q9DAW6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms