Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Subh2bvQ9D9Z7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Subh2bvQ9D9Z7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
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