Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calr3Q9D9Q6 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms