Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd9Q9D9M4 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd9Q9D9M4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd9Q9D9M4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd9Q9D9M4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd9Q9D9M4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pdzd9Q9D9M4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pdzd9Q9D9M4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pdzd9Q9D9M4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdzd9Q9D9M4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Pdzd9Q9D9M4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdzd9Q9D9M4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pdzd9Q9D9M4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms