Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usp12Q9D9M2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp12Q9D9M2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms