Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx5Q9D8U8 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx5Q9D8U8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Snx5Q9D8U8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Snx5Q9D8U8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Snx5Q9D8U8 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Snx5Q9D8U8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Snx5Q9D8U8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Snx5Q9D8U8 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Snx5Q9D8U8 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx5Q9D8U8 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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