Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gtf3c6Q9D8P7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gtf3c6Q9D8P7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Gtf3c6Q9D8P7 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gtf3c6Q9D8P7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gtf3c6Q9D8P7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gtf3c6Q9D8P7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gtf3c6Q9D8P7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Gtf3c6Q9D8P7 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gtf3c6Q9D8P7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gtf3c6Q9D8P7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Gtf3c6Q9D8P7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gtf3c6Q9D8P7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gtf3c6Q9D8P7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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