Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chmp4bQ9D8B3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Chmp4bQ9D8B3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms