Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Tmem54Q9D7S1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Tmem54Q9D7S1 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tmem54Q9D7S1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tmem54Q9D7S1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Tmem54Q9D7S1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem54Q9D7S1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
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