Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Klhl40Q9D783 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms