Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Borcs6Q9D6W8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
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Borcs6Q9D6W8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Borcs6Q9D6W8 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms