Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

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Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PudpQ9D5U5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PudpQ9D5U5 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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