Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc83Q9D4V3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc83Q9D4V3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms