Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ribc2Q9D4Q1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms