Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pabpc6Q9D4E6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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