Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bcas2Q9D287 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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