Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Necap2Q9D1J1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms