Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lmbr1lQ9D1E5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms