Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hddc3Q9D114 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms