Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Tmem88Q9D0N8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Tmem88Q9D0N8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms