Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Zbed3Q9D0L1 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbed3Q9D0L1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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