Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Shisa9Q9CZN4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Shisa9Q9CZN4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms