Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ9

Dnajc18, DnaJ homolog subfamily C member 18, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc18Q9CZJ9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Dnajc18Q9CZJ9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Dnajc18Q9CZJ9 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms