Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snf8Q9CZ28 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snf8Q9CZ28 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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