Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rrs1Q9CYH6 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms