Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ChtopQ9CY57 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms