Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY34

Ube2f, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fQ9CY34 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ube2fQ9CY34 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms