Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mis12Q9CY25 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mis12Q9CY25 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms