Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

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Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Bud23Q9CY21 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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