Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Xrcc3Q9CXE6 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Xrcc3Q9CXE6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms