Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Rpusd4Q9CWX4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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