Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ly6kQ9CWP4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms