Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Cdca4Q9CWM2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Cdca4Q9CWM2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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