Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWL8

Ctnnbl1, Beta-catenin-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ctnnbl1Q9CWL8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms