Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Lhfpl3Q9CTN8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms