Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Fcf1Q9CTH6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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