Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pard3bQ9CSB4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pard3bQ9CSB4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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